两税合并除了合并内外资企业所得税外，区域优惠政策也将发生调整，这一政策对当前经济特区、经济开发区吸引外资也将产生影响。
税收优惠政策取消反响不一
浙江富阳经济开发区，是浙江省首批省级经济开发区。
该开发区去年招商引资共8400万美元，其中80％－90％是外资企业，包括制造业、纺织、服装、制药、生物工程等多个行业。富阳经济开发区区委负责人在接受记者采访时说，统一后的企业所得税法将会一定程度上削弱开发区招商引资的优势，但影响到底有多少，目前还不好评判。
商务部统计数据显示，中国已经连续13年位列发展中国家及亚洲国家吸收FDI最多的国家之首。在吸引外商纷至沓来的众多因素中，一个重要原因就是税收优惠。
对于税收优惠政策取消的影响，也有开发区认为影响不大。西安国家级经济技术开发区区委负责人告诉记者，税收、土地出让等方面的老优惠政策在不断发展的经济面前已经失去了魅力。资源、地理位置、交通等配套措施才是开发区的核心竞争力。该负责人说，目前他们所走之路是，发展产业链招商，通过加强服务，为已经招来的投资商，建立一条完整的产业链，再吸引这一产业链上下游的更多投资者，而不是再依赖曾经的税收优惠政策。
青海省城东区经济开发区、东莞松山湖经济开发区、北京经济技术开发区等开发区相关负责人也表示这一政策对开发区影响并不大。
经济特区享受过渡性优惠
对于新企业所得税法对区域经济发展产生的影响，天津滨海新区管委会主任皮黔生表示，“从理论和长期效应来看，市场化是振兴区域经济的必然之路，但从短期来看，就是给谁的支持大，谁发展快。”
在皮黔生看来，税收优惠政策在短期内可以有力促进一个地区的经济发展。他说，目前外商直接投资是滨海新区发展的支撑力，内外资税率统一和取消外资“两免三减”优惠后，对外资继续投资的影响很大。
为此，他向本次大会提议，建议天津滨海新区能够和上海浦东新区并列享受过渡性优惠，能够把天津滨海新区真正纳入为区域经济发展的新的增长点，能够和经济特区、上海浦东新区一样对待。
为了保持政策的连贯性，新的税法规定将继续给予经济特区（深圳特区）和浦东新区优惠政策，授予国务院制定过渡性政策，在这些地区内新设立的国家重点扶持高新技术企业，可享受过渡性优惠。
但就是仍可以享受五年过渡期的深圳和上海这两个地区的代表也发出了类似的声音。全国政协委员、曾任深圳市委书记的厉有为向本次大会提交提案称，如果统一后的外资所得税高于香港17.5%的税率，其间的落差势必会影响到香港和深圳的产业优势互补，影响香港和深圳的国际竞争力。
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